Спустя два года после нападения Helghast на Vekta, ISA переносит театр военных действий на планету своего врага Helghan. В killzone 2 Вы будете играть за Sev - ветерана войск специального назначения под названием Legion, вы отправитесь на планету Helghan. В killzone 2 от вас потребуется захватить лидера Helghast императора Visari и остановить войну. Но для Sev и его команды вторжение на Helghan это только начало. Также на вас возложена задача обеспечения защиты столицы Pyrrhus,но вскоре команда понимает, что Helghast являются еще более сложными противниками на их родной планете.  Helghast черпают энергию из среды, которая может быть использована против ISA. В скором времени Sev и его команда понимают, что им придется не только уничтожать многочисленные войска противника, но и научиться справляться с враждебными условиями планеты  Helghan.